Geometry-based Algorithm for Detection of Asymmetric Tunnels in Protein Molecules

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky Geometrické algoritmy pro detekci asymetrických tunelů v proteinech
Autoři

BYŠKA Jan JURČÍK Adam SOCHOR Jiří

Rok publikování 2013
Druh Článek ve sborníku
Konference TPCG 2013
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
Obor Informatika
Klíčová slova voxels;protein; tunnel; computational geometry; visualization
Popis We present a novel geometry-based method for computing asymmetric tunnels and voids in proteins, approximating their real shape with selected precision. Our method combines ideas from Voronoi and grid based approaches for protein analysis. We represent tunnels in protein using voxel data grid which allows us to store their shape more accurately. Our algorithm employs a tunnel skeleton computed using Voronoi diagram. The skeleton allows us to perform grid computation in a bounded space, with lower time and memory demands, and easily identify and measure individual tunnels.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.