AEON.py: Python library for attractor analysis in asynchronous Boolean networks

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

BENEŠ Nikola BRIM Luboš HUVAR Ondřej PASTVA Samuel ŠAFRÁNEK David ŠMIJÁKOVÁ Eva

Rok publikování 2022
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj BIOINFORMATICS
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
www https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac624
Doi http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btac624
Klíčová slova Boolean Networks; Attractors; Software
Popis AEON.py is a Python library for the analysis of the long-term behaviour in very large asynchronous Boolean networks. It provides significant computational improvements over the state-of-the-art methods for attractor detection. Furthermore, it admits the analysis of partially specified Boolean networks with uncertain update functions. It also includes techniques for identifying viable source-target control strategies and the assessment of their robustness with respect to parameter perturbations.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.