Worldwide Protein Data Bank validation information: usage and trends

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři

SMART Oliver S. HORSKÝ Vladimír GORE Swanand SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka BENDOVÁ Veronika KLEYWEGT Gerard J. VELANKAR Sameer

Rok publikování 2018
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Acta Crystallographica Section D
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
www https://journals.iucr.org/d/issues/2018/03/00/ba5288/index.html
Doi http://dx.doi.org/10.1107/S2059798318003303
Klíčová slova PDB; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; quality control; X-ray crystallography; ValTrendsDB
Popis It is shown how validation metrics can be combined to produce an overall score that allows the ranking of macromolecular structures and domains in search results. Additionally, ValTrendsDB database is presented: It provides users with a convenient way to access and analyse validation information and other properties of X-ray crystal structures in the PDB, including investigating trends in and correlations between different structure properties and validation metrics.
Související projekty: