RIAssigner: A package for gas chromatographic retention index calculation

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele
Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

HECHT Helge SKORYK Maksym ČECH Martin PRICE Elliott James

Rok publikování 2022
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Journal of Open Source Software
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
www Article
Doi http://dx.doi.org/10.21105/joss.04337
Klíčová slova gas chromatography; retention index; analytical chemistry
Přiložené soubory
Popis RIAssigner is a software package for the computation of gas chromatographic (GC) retention indices (RI). The package uses matchms (Huber et al., 2020) and pandas (The pandas development team, 2020) for data I/O and supports the .msp as well as tabular (.csv & .tsv) formats, among others. It supports multiple keywords identifying the retention time (RT) and RI information and handling SI units for RT. The RI can be computed using non-isothermal Kováts retention-indexing (from temperature programming, using the definition of van Den Dool & Kratz (1963)) or cubic spline interpolation (Halang et al., 1978) based on a reference dataset containing RT & RI. The MIT-licensed package is hosted via bioconda (Grüning et al., 2018) and is also accessible to users as a Galaxy tool (Jalili et al., 2020; Spectrometric Data Processing and Analysis & Institute of Computer Science, 2022).
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.