Phenotype Control of Partially Specified Boolean Networks

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

BENEŠ Nikola BRIM Luboš PASTVA Samuel ŠAFRÁNEK David ŠMIJÁKOVÁ Eva

Rok publikování 2023
Druh Článek ve sborníku
Konference Computational Methods in Systems Biology
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
www https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-031-42697-1_2
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-42697-1_2
Klíčová slova Boolean networks;Partial specification;Permanent control;Phenotype;Perturbation;Symbolic algorithm
Popis Partially specified Boolean networks (PSBNs) represent a promising framework for the qualitative modelling of biological systems in which the logic of interactions is not completely known. Phenotype control aims to stabilise the network in states exhibiting specific traits. In this paper, we define the phenotype control problem in the context of asynchronous PSBNs and propose a novel semi-symbolic algorithm for solving this problem with permanent variable perturbations.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.