Computation of tunnels in protein molecules using Delaunay triangulation

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Výpočet tunelů v proteinech pomocí Delaunayovy triangulace
Autoři

MEDEK Petr BENEŠ Petr SOCHOR Jiří

Rok publikování 2007
Druh Článek ve sborníku
Konference Journal of WSCG
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
www http://wscg.zcu.cz/WSCG2007/Papers_2007/journal/F53-full.pdf
Obor Informatika
Klíčová slova tunnels; protein molecule; Delaunay triangulation
Popis Článek představuje novou metodu analýzy kavit v molekulách proteinů. Biochemický výzkum ukázal, že chování molekuly proteinu závisí na existenci kavit (tunelů), které vedou ze vnitřku molekuly na povrch. Předchozí metody výpočtu tunelů byly založeny na rasterizaci prostoru. Náš přístup je založen na výpočetní geometrii a používá Voroného diagram a Delaunayovu triangulaci. Naše metoda určí tunely v lepší kvalitě v přijatelném výpočetním čase. Navržený algoritmus byl implementován a testován na několika reálných proteinech. Nalezne uplatnění v různých aplikacích moldeování proteinů a jejich analýzy.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.